В основу экспозиции положены предметы московского быта XV—XVII веков. Это берестяные поплавки, сделанные из белого камня и глины грузила, замки, ножи и даже гигиенические приспособления для ушей.

Ещё один интересный экспонат музея — «испанский клад». Эта находка представляет собой доверху наполненный колониальными испанскими серебряными монетами медный таз. Среди найденных монет обнаружилась и одна фальшивая, отчеканенная из бронзы.

В ходе тематических экскурсий посетители могут примерить на себя костюмы средневековых москвичей, познакомиться с бытом русской столицы той эпохи. На проводимых в музее бесплатных занятиях школьники могут не только рассмотреть многочисленные археологические находки, но и ознакомиться с методами научных исследований, используемых при раскопках.

По выходным дням музей приглашает на тематические игры и викторины, посвящённые важным событиям в истории российской столицы.